The 100 seizoen 6

Murphy, Emori, Echo, Raven, Shaw en Abby ontwaken uit hun cryoslaap en worden door Clarke, Bellamy en Jordan op de hoogte gebracht van de nieuwe planeet. Doordat de ionosfeer van de planeet geen enkele vorm van communicatie toelaat, is het onduidelijk of de bemanning van Eligius III nog steeds aanwezig is. Deze kwam namelijk 236 jaar eerder, in het jaar 2045, aan op de planeet. Een onderzoeksteam met onder andere Clarke, Bellamy en Shaw wordt via de Gagarin naar de grond gestuurd en ontdekt al snel dat de planeet niet onbewoond is. Zo stuiten ze op een elektrisch schild met daarop het logo van de Eligius Corporation. Shaw wordt geëlektrocuteerd door het schild en sterft. Wanneer later een deel van de rest van de groep ook geland is, raken ze met de hulp van een onbekende wel door het schild heen. Ze ontdekken dat de planeet bewoond wordt door een vredig volk, dat hun wereld "Sanctum" noemt. Sanctum blijkt te worden beïnvloed door de twee zonnen. Als de zonnen in één lijn staan, wordt iedereen op de planeet gewelddadig tegenover elkaar.

Het leven van de machthebbers op Sanctum, onder leiding van Russell Lightbourne, wordt geregeld door een vorm van reïncarnatie. De eerste generatie van bewoners van de planeet, de "Primes" genaamd, hebben hun geest laten opslaan in een "Mind Drive" die gecreëerd werd door Becca Franco, tevens de uitvindster van A.L.I.E. Hierdoor kan de persoon eeuwig voortleven in andere lichamen, mits die lichamen nachtbloed hebben. De geest en gedachten van het nieuwe lichaam, de "Host" genoemd, maken dan plaats voor de gedachten van de Prime. Zo is het mogelijk dat de Russell Lightbourne in 2281 dezelfde persoon is als de Russell Lightbourne die in 2045 aankwam op de nieuwe planeet. Op de "Naamdag" wordt een chip van de Primes geïmplanteerd in een nieuwe Host. De inwoners van Sanctum zien de Primes, mede door de reïncarnatie, als goden. Wanneer blijkt dat Clarke nachtbloed heeft, wordt ze door Russell en zijn vrouw Simone gedood om haar lichaam als Host te laten fungeren voor hun dochter Josephine. Er gaat echter iets fout en Clarkes geest blijft actief, terwijl Josephines geest de controle heeft over het lichaam. In de strijd om Clarkes lichaam komen ze herinneringen uit hun levens tegen.

Intussen wordt Abby op het moederschip gedwongen om Simone te laten zien hoe een nachtbloed gemaakt kan worden. Abby slaagt er op die manier in Kane van de dood te redden door zijn geheugen in het lichaam van een Host te implanteren. Kane kan echter niet leven met het idee dat het leven van een onschuldige man is genomen om dat van hem te redden en pleegt zelfmoord door zichzelf via een luchtsluis van Eligius IV in de ruimte te schieten.

Als Clarke uiteindelijk samen met de gevluchte Prime Gabriel Santiago een manier heeft gevonden om Josephine uit haar lichaam te krijgen, wordt Josephines geest uit Clarkes lichaam verwijderd. Bellamy had echter afgesproken dat Russell de Mind Drive van Josephine zou krijgen, in ruil voor de aardlingen die door Russell gevangen worden gehouden. Nu Josephine dood is, hebben ze dus geen middel meer om met de Primes te onderhandelen. Ondertussen neemt een inwoner van Sanctum wraak op de Primes door een aanslag te plegen op Simone. Haar Host sterft, maar Russell weet haar Mind Drive te redden. Octavia, Bellamy en Clarke hebben inmiddels een verbond gesloten met de volgers van Gabriel en samen bedenken ze een plan. Om hun plan te laten werken, doet Clarke zich voor als Josephine en infiltreert ze in Sanctum.

Wanneer de Primes beginnen met het aftappen van Madi's nachtbloed, injecteert Abby zichzelf met het serum om zo ook een nachtbloed te worden en Madi te beschermen. Als Russell dit opmerkt, ziet hij in Abby de perfecte nieuwe Host voor zijn vrouw. Abby wordt daarop gedood en Simone herrijst in haar lichaam. Nadat Russell gif van de Rode Zon over Sanctum laat neerdalen in de hoop de inwoners die niet geloven in de goddelijkheid van de Primes onschadelijk te maken, vertrekken de Primes met Madi, Raven en Gaia als gevangenen naar Eligius IV.

De Primes maken een plan om de geest van de overgebleven leden van Wonkru, die nog steeds in cryoslaap zijn, te verwijderen. Daarna willen ze naar planeet Bèta vertrekken, de eerstvolgende planeet in het zonnestelsel. Clarke kan haar vermomming als Josephine niet langer vasthouden en saboteert het plan van de Primes. Ze opent een luchtsluis waardoor, op Russell na, de overgebleven Primes de ruimte in worden geschoten, inclusief Simone in het lichaam van Abby. Nadat Madi als commandant Wonkru ervan overtuigt om Russell gevangen te nemen, vertrekken ze terug naar Sanctum. Daar worden ze herenigd met hun vrienden.

Ondertussen ontdekt Gabriel vreemde tekens op de rug van Octavia, die volgens hem veroorzaakt zijn door de Anomaly. Hij besluit samen met Octavia, Bellamy en Echo naar een speciale steen te gaan, waarop hij de tekens die op de rug van Octavia staan indrukt. Meteen daarna verschijnt de Anomaly, net als Diyoza's volwassen dochter Hope, die naar Octavia loopt en zegt: 'Het heeft mijn moeder.' Vervolgens steekt Hope haar neer, waarop Octavia verdwijnt in de armen van Bellamy. Daarop valt Hope flauw, terwijl Bellamy naar buiten rent om Octavia te zoeken.