Lost seizoen 2

Een aantal nieuwe personages, zoals Ana Lucía Cortez , Libby en Mr. Eko, doet zijn intrede wanneer blijkt dat er op een andere plaats op het eiland overlevenden zijn uit het staartgedeelte van het vliegtuig. Ook het Dharma-initiatief (The Dharma Initiative) en de financierder (The Hanso Foundation) doen hun intrede. Zij zouden verantwoordelijk kunnen zijn voor de mysterieuze gebeurtenissen op het eiland. In een van de bunkers van het Dharma-initiatief die inmiddels is geopend, en die beheerd wordt door Desmond Hume, krijgen hun leden onder andere een film te zien waarin uitleg wordt gegeven over wat ze moeten doen om 'de wereld te redden': elke 108 minuten moet een sequentie (4, 8, 15, 16, 23, 42) worden ingetypt en op het knopje 'execute' worden gedrukt. Dit zet de teller weer op 108.

Later vindt Mr. Eko nog een stukje film dat uit de eerste film is geknipt. Hierin zien de overlevenden dat ze niet met de computer mogen communiceren met de buitenwereld. John Locke begint nu te twijfelen over de knop waar ze om de 108 minuten op moesten drukken na het intikken van deze code. Aan het einde van het seizoen, na een flinke discussie met Desmond, besluit John de knop niet in te drukken. Hierdoor ontstaat een magnetisch krachtveld, waarbij de bunker implodeert en de lucht paars wordt. De hele bunker wordt vernield. Michael heeft echter hiervoor in de bunker contact gehad met zijn ontvoerde zoon Walt, en heeft na zijn zoon te hebben gezocht een afspraak gemaakt met de Anderen. Michael moet Jack, Kate, Sawyer en Hurley naar hen toe brengen, waarna Michael en Walt een boot zullen krijgen om van het eiland af te varen.